Badanie długich niekodujących RNA przy użyciu modeli zwierzęcych ad 8

Możliwy fenotyp może obejmować duże spektrum składające się z efektów biochemicznych, anatomicznych, fizjologicznych lub behawioralnych, a zatem brak zgłoszonego fenotypu może po prostu reprezentować ograniczony wybór nienaruszonych fenotypów. Efekty kompensacyjne mogą dodatkowo łagodzić pojawianie się fenotypu. Alternatywne podejścia. Nadekspresja lncRNA jest alternatywną strategią oceny jej efektów fenotypowych. To podejście zostało z powodzeniem zastosowane w modelach zwierzęcych przy użyciu genów kodujących białka do badania zaburzeń neuropsychiatrycznych, które mogą wynikać z braku utrzymania homeostazy po uzyskaniu lub utracie ekspresji genów (117). Po zastosowaniu do lncRNA, eksperymenty z nadekspresją mogą wytworzyć fenotyp przeciwny, który występuje po ablacji lncRNA, wskazując dwukierunkowe efekty poziomów ekspresji lncRNA. Alternatywnie, mogą wywoływać fenotyp, który jest nieobecny lub pozornie niezwiązany z fenotypem obserwowanym po ablacji lncRNA. Jednak takie podejście ma zastosowanie tylko do trans-działających lncRNA, których funkcja jest niezależna od ich miejsca integracji genomowej. Technologia edycji genomu. Duże postępy technologiczne w zakresie edycji genomu (118) otwierają możliwość zmiany genomów nie tylko konwencjonalnych organizmów modelowych, ale także mniej powszechnie używanych modeli zwierzęcych, które historycznie były mniej podatne na zmiany. Testy TALEN lub klastrowane, regularnie przeplatane powtórzenia palindromiczne (CRISPR / Cas9) były szeroko stosowane do wycinania lub odwracania regionów locus lncRNA u danio pręgowanego (119, 120), myszy (121, 122) i szczurów (123). Technologie te mogą zostać rozszerzone na inne modele zwierzęce, przyjęte na wyspecjalizowane obszary badań, takie jak świnia stosowana do modelowania mukowiscydozy (124), ptak śpiewający używany do modelowania akwizycji języka (125) oraz nieczłowiek naczelny używany do modelowania neurodegeneratywnego zaburzenie choroby Huntingtona (126, 127). Jednak wciąż istnieją zastrzeżenia i obawy podobne do wcześniej omówionych w odniesieniu do standardowych metod ukierunkowanych na DNA, biorąc pod uwagę stosunkowo duże segmenty genomu, które mogą wymagać zmiany w celu wpływania na ekspresję i funkcję lncRNA. Wnioski Modele zwierzęce są obiecującymi narzędziami pomagającymi w odkryciu nowych lncRNA i badaniu fenotypowej istotności tych cząsteczek. Jednakże, lncRNA z natury różnią się od ich odpowiedników kodujących białka, a zatem ich badanie wymaga pokonania wielu ważnych nowych wyzwań i zajęcia się nowymi rozważaniami w odniesieniu do eksperymentalnego projektowania i interpretacji danych. Pomimo tych ograniczeń udało się przekonująco wykazać, że dysfunkcja lncRNA w modelach zwierzęcych powoduje różne fenotypy, od letalności do subtelnych dysmorfofobii. Jak dotąd oceniano tylko część lncRNA, a ta istotna luka w wiedzy podkreśla pilną potrzebę wyjścia poza początkowy katalog lncRNA i zrozumienia ich wpływu in vivo. Przewidujemy, że te wstępne wyniki stanowią obiecujący początek różnorodnych funkcji lncRNA in vivo oraz w zrozumieniu ich znaczenia dla choroby. Podziękowania Dziękujemy Andrew Holmes, Caroline Siebald i członkom laboratorium Goff za pomocne komentarze podczas przygotowywania tego manuskryptu. Przypisy Konflikt interesów: LA Goff jest współtwórcą dwóch patentów, z których żaden nie jest bezpośrednio związany z manuskryptem: (a). Wysokoprzepustowa metodologia do identyfikacji interakcji RNA-białko Transcriptome-wide ,. BD Gregory, JL Rinn, F. Li, LA Goff i C. Trapnell (patent USA nr 9 097 708 B2); i (b). Racjonalna optymalizacja sondy do wykrywania mikromacierzy mikroRNA,. R. Getts, RP Hart i LA Goff (zgłoszenie patentowe US nr PCT / US2005 / 038261). Informacje referencyjne: J Clin Invest. 2016; 126 (8): 2783. 2791. doi: 10.1172 / JCI84422.
[patrz też: bodyspace efekty, apteczka pierwszej pomocy nie powinna zawierać, body space tychy ]
[więcej w: tabletki na nerwy bez recepty, żel pod prysznic bez sls, stosowanie tabletek antykoncepcyjnych ]